[Paper] Use of Digital Image Analysis, Viability Stains, and Germination Assays to Estimate Conventional and Glyphosate-resistant Cotton Pollen Viab..

September 24th, 2007 by basa
作者: Wendy A. Pline, Keith L. Edmisten, Tim Oliver, John W. Wilcut, Randy Wells,
and Nina S. Allen
出處: Crop Science (2002) 42: 2193-2200
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作者比較了四種不同估計花粉活性的方法，分別是Brewbaker & Kwack (B & K) medium (就是蔗糖溶液以及少許的硼和鈣、Pollen
germination test in vitro)、B & K medium 加上 aniline blue、fluorochromatic reaction method (FCR)、還有Alexander’s stain。
作者用棉花的花粉進行測試。除了以上述四種方式估計花粉活性，作者也對棉花進行人工授粉實驗，得到結實率以後再和四種活性測試的值進行比較，看看哪一種方法和結實率的相關性最高。

此外，作者嘗試將花粉萌發的結果照相紀錄，並用影像軟體分析花粉管的面積，藉由比較花粉管面積的大小，可以增加對花粉活性的參考資
料。實驗的結果顯示，B & K medium和結實率的相關性最高，除此之外，作者認為B & K medium實驗簡單，需要的特殊器材少，以及允許影像處理分析花粉管的面積，因此是值得推薦的方法。

最後再補充一下為什麼作者的試驗方法中，其中一項是在B & K medium中加入aniline blue。由於在蔗糖溶液中，花粉有時會受到滲透壓的影響而爆裂放出一些花粉內的物質，這種情形並不是真正的花粉萌發，但是在外觀上有時會很類似正常萌發的花粉管，因此造成計算萌發率時的困擾。正常的花粉管含有callose，callose會出現在花粉管中(callose plug)，而且花粉管璧的成分也包含callose，因此我們可以試著用aniline blue對花粉管染色，如果是正常的花粉管，就會成功染上色，藉以判斷花粉是否正常萌發。

[Paper]植物的種化

September 17th, 2007 by pai
作者: Loren H. Rieseberg and John H. Willis
出處: Science 2007, 317:910-914 | Supporting Material
說明: 如標題所述，這是一篇關於植物種化的Review。今天中午王俊能老師已經介紹過他的內容，而其附錄中整理了許多關於植物種化相關的研
究，這學期要參與討論的人可以參考一下。

Diversification and co-option of RAD-like genes in the evolution of floral asymmetry.

September 5th, 2007 by easss
期刊 Plant Journal 2007 Aug 2
作者:Baxter CE, Costa MM, Coen ES.
簡介:如題所示, 又一篇關於花的對稱性相關的paper出來了,作者藉由金魚草和阿拉伯芥中RAD基因的 duplication and divergence認為RAD基因參與了一系列分子間或分子內的調控改變,有興趣者可以去看看…

[Paper] Genetic and physical maps around the sex-determining M-locus of the dioecious plant asparagus

September 4th, 2007 by aerobe
作者： Alexa Telgmann-Rauber, Ari Jamsari, Michael S. Kinney,
J. Chris Pires and Christian Jung Koonin
出處： Mol Genet Genomics 2007, 278:221-234
說明：
Asparagus ocinalis L. (蘆筍)為雌雄異株的植物。其同型性染色體上有個M-locus區域，其功能為調控雌雄的性狀。本篇研究即為將蘆筍的性別決定區域選殖出來，及研究此區域的構造。作者更進一步推測Silene、木瓜以及蘆筍代表了XX、XY性別決定系統在演化上的三個階段。

[Paper] Dating the origin of the Orchidaceae from a fossil orchid with its pollinator

September 4th, 2007 by aerobe
作者： Santiago R. Ramı´rez, Barbara Gravendeel, Rodrigo B.
Singer, Charles R. Marshall and Naomi E. Pierce
出處： Nature 2007, 448:1042-1045
說明：
自從達爾文時代以來，生物學家一直為蘭花和它們的授粉者之間的親密關係著迷。這種關係之久遠，從本期封面所示化石就可見一斑。化石中是一只無刺的工蜂，帶著蘭花的一個花粉塊，保存在距今1,500萬至2,000萬年前的琥珀中，是在多米尼加共和國發現的。這個花粉塊是雄性生殖結構，在授粉期間作為一個結構單位被轉移，帶有一團花粉顆粒。該發現讓人吃驚之處是，它是第一個明確來自蘭科的化石。花粉塊的形態說明該蘭花屬於斑葉蘭（Goodyerinae）。通過將這一信息與來自其他相關化石植物的年代數據結合起來，研究人員便獲得了對蘭科植物分子系統發生學的一個新的校正結果。分析結果否定了蘭花起源於較近年代（第三紀）的假設；相反，它表明它們起源於距今8,000萬年前的晚白堊紀。

[Paper] The evolution of selfing in Arabidopsis thaliana

August 30th, 2007 by pai
作者: Tang C, Toomajian C, Sherman-Broyles S, Plagnol V, Guo YL, Hu TT, Clark RM, Nasrallah JB, Weigel D, Nordborg M 2007.
出處: Science 2007, 317(5841):1070-2
說明: 阿拉伯芥是一種以自交為主的植物，但該分類群主要都是自交不親和(self-imcompatibility, SI)的物種，且已知其SI的機制由一個S locus
所控制。本篇作者分析了阿拉伯芥中S locus的序列變異，認為阿拉伯芥變成可以自交，應該不是由一個單一演化事件，即該基因失去功能所引起。

[Paper] The Greening of Plant Genomics

August 30th, 2007 by pai
作者： Elizabeth Pennisi
出處： Science 2007, 317:317
說明：
As the National Plant Genome Initiative turns 10, it is beefing up its bioinformatics and its portfolio of sequenced crop and
noncrop genomes.