Tuesday, July 28, 2009

[Paper] Ants Sow the Seeds of Global Diversification in Flowering Plants

者:Szabolcs Lengyel, Aaron D. Gove, Andrew M. Latimer, Jonathan D. Majer, Robert R. Dunn, Jerome Chave
出處:PloS ONE. 2009. 4. e5480.
摘要:
被子植物在白堊紀和第三紀大量分化,與動物的互相影響被認為是主因,例如與受粉者的共演化就是其中一個例子,另外,動物對於被子植物的種子傳播也有重要的影響。過去有學者認為,利用螞蟻傳播種子 (myrmecochory)這項特徵會促進植物的分化。這是因為螞蟻通常會把種子移到利於種子萌發的地方,促使植物滅絕的機率降低,另外螞蟻的傳播種子距離很短,這會使處在很小的地理範圍內的植物族群發生族群內的分化。
本文比較了具有myrmecochory這項特徵的分類群與其sister group的物種數與分化速率,結果以螞蟻散播種子的分類群具有較多的種數與較高的分化速率,作者認為myrmecochory對植物的分化有重要的影響。

Monday, July 13, 2009

悲慘的犯錯科學家

Title: Life after fraud
Source: The Scientist 2009 23:28.
Note:
這是最近一篇有關曾經被判定違反科學倫理案件的人的訪談記錄。文章主要在說一些簽了認罪協定的一些科學家,他們後來的生活。有些違反科學倫理的判例,是申請計畫停權3-5年,理論上之後是可以回復一般人的生活,但是因為現在google太發達,每個人一查都會出現他的犯錯記錄。因此punishment永遠陰魂不散,基本上非常難再找到工作。有意思的是,在回覆的comments中,幾乎一面倒的沒有人同情這些科學家。看來我們真的要非常小心。

註:會看這篇文章,是因為最近又有一個scientific misconduct的新聞,有關阿拉巴馬大學研究人員被發現在8年研究期間實驗作假,所發表的16篇文章,現在都全數撤回(retract)。

Wednesday, June 10, 2009

The fading field

Title: The fading field - traditional taxonomy
Source: The Scientist http://www.the-scientist.com/article/display/55708/
Note: 這篇有關關心分類學的存續的文章,請有心人參考。

Wednesday, June 3, 2009

[Review] Ecology and evolution of plant–pollinator interactions

出處: Annals of botany, 2009, Volume 103, Number 9
摘要: 本期Ann bot為plant-pollinator研究的最新整理報導。題目如下, 有興趣者可參考。
Randall J. Mitchell, Rebecca E. Irwin, Rebecca J. Flanagan, and Jeffrey D. Karron
Ecology and evolution of plant–pollinator interactions 
Ann Bot 2009 103: 1355-1363
Kazuharu Ohashi and James D. Thomson
Trapline foraging by pollinators: its ontogeny, economics and possible consequences for plants 
Ann Bot 2009 103: 1365-1378
Jeffrey D. Karron, Karsten G. Holmquist, Rebecca J. Flanagan, and Randall J. Mitchell
Pollinator visitation patterns strongly influence among-flower variation in selfing rate 
Ann Bot 2009 103: 1379-1383

Yoshiaki Kameyama and Gaku Kudo
Flowering phenology influences seed production and outcrossing rate in populations of an alpine snowbed shrub, Phyllodoce aleutica: effects of pollinators and self-incompatibility 
Ann Bot 2009 103: 1385-1394

Robert J. Whelan, David J. Ayre, and Fiona M. Beynon
The birds and the bees: pollinator behaviour and variation in the mating system of the rare shrubGrevillea macleayana
Ann Bot 2009 103: 1395-1401
Randall J. Mitchell, Rebecca J. Flanagan, Beverly J. Brown, Nickolas M. Waser, and Jeffrey D. Karron
New frontiers in competition for pollination
Ann Bot 2009 103: 1403-1413  

Carlos M. Herrera, Clara de Vega, Azucena Canto, and María I. Pozo
Yeasts in floral nectar: a quantitative survey
Ann Bot 2009 103: 1415-1423 

Rebecca E. Irwin
Realized tolerance to nectar robbing: compensation to floral enemies in Ipomopsis aggregata 
Ann Bot 2009 103: 1425-1433

Judith L. Bronstein, Travis Huxman, Brianna Horvath, Michael Farabee, and Goggy Davidowitz
Reproductive biology of Datura wrightii: the benefits of a herbivorous pollinator  
Ann Bot 2009 103: 1435-1443  

Diego P. Vázquez, Nico Blüthgen, Luciano Cagnolo, and Natacha P. Chacoff
Uniting pattern and process in plant–animal mutualistic networks: a review 
Ann Bot 2009 103: 1445-1457

Martina Stang, Peter G. L. Klinkhamer, Nickolas M. Waser, Ingo Stang, and Eddy van der Meijden
Size-specific interaction patterns and size matching in a plant–pollinator interaction web  
Ann Bot 2009 103: 1459-1469
Jeff Ollerton, Ruben Alarcón, Nickolas M. Waser, Mary V. Price, Stella Watts, Louise Cranmer, Andrew Hingston, Craig I. Peter, and John Rotenberry
A global test of the pollination syndrome hypothesis 
Ann Bot 2009 103: 1471-1480  

Nathan Muchhala, Angelica Caiza, Juan Carlos Vizuete, and James D. Thomson
A generalized pollination system in the tropics: bats, birds and Aphelandra acanthus  
Ann Bot 2009 103: 1481-1487  

Boris O. Schlumpberger, Andrea A. Cocucci, Marcela Moré, Alicia N. Sérsic, and Robert A. Raguso
Extreme variation in floral characters and its consequences for pollinator attraction among populations of an Andean cactus 
Ann Bot 2009 103: 1489-1500  

Jeff Ollerton, Siro Masinde, Ulrich Meve, Mike Picker, and Andrew Whittington
Fly pollination in Ceropegia (Apocynaceae: Asclepiadoideae): biogeographic and phylogenetic perspectives 
Ann Bot 2009 103: 1501-1514  

Jannice Friedman and Spencer C. H. Barrett
Wind of change: new insights on the ecology and evolution of pollination and mating in wind-pollinated plants 
Ann Bot 2009 103: 1515-1527 
W. Scott Armbruster, Thomas F. Hansen, Christophe Pélabon, Rocío Pérez-Barrales, and Johanne Maad
The adaptive accuracy of flowers: measurement and microevolutionary patterns 
Ann Bot 2009 103: 1529-1545  

Jeffrey K. Conner, Heather F. Sahli, and Keith Karoly
Tests of adaptation: functional studies of pollen removal and estimates of natural selection on anther position in wild radish 
Ann Bot 2009 103: 1547-1556  

Diane R. Campbell
Using phenotypic manipulations to study multivariate selection of floral trait associations 
Ann Bot 2009 103: 1557-1566  

Johanne Brunet
Pollinators of the Rocky Mountain columbine: temporal variation, functional groups and associations with floral traits 
Ann Bot 2009 103: 1567-1578  
Marcelo A. Aizen, Lucas A. Garibaldi, Saul A. Cunningham, and Alexandra M. Klein
How much does agriculture depend on pollinators? Lessons from long-term trends in crop production 
Ann Bot 2009 103: 1579-1588  
Eric Lonsdorf, Claire Kremen, Taylor Ricketts, Rachael Winfree, Neal Williams, and Sarah Greenleaf
Modelling pollination services across agricultural landscapes 
Ann Bot 2009 103: 1589-1600


Thursday, May 21, 2009

[Paper] Evolutionary Conditions for the Emergence of Communication in Robots

者:Dario Floreano, Sara Mitri, Stephane Magnenat and Laurent Keller 
出處:Current Biology. 2007. 17. 514.
(
Link to the article)
摘要: 
      本文作者利用機器人來模擬群體生物中溝通行為的演化。他們將十個機器人放在一塊區域中,這塊區域包含兩個裝置: "food source" (機器人碰到以後會充電)與 "poison" (機器人碰到以後電力會降低)。而他們設計的機器人具有會發光的環,攝影機與模擬神經電路程式,這樣的設計使機器人可以發光,並且在距離很近的時候看到其他機器人的光,而神經電路程式則決定了機器人如何發光與看到光之後如何反應,這些程式也加入了一些允許 "突變 "的機會。在每次的實驗後,他們會選出擁有最多電力的機器人,然後將其程式灌到下一代的機器人,重新開始試驗。簡而言之,他們希望模擬某些動物在自然界覓食,躲避危險等事件並且加入選汰的壓力。
     經過500代以後,某些族群的機器人演化出了互助合作的模式,他們碰到"food source" 或"poison"時會發光通知其他機器人,也有的族群中出現了一些騙子,他們碰到 "poison"時會告訴其他機器人這是 "food source"。
心得:
以上的連結可以找到實驗影片,機器人實在太可愛了!!!
以下是一些網站的介紹:
我的介紹太過於簡化了,因為我很多東西都看不懂,大家有興趣自己看看...,總之我的感想是這個實驗很天才。
      
     

Tuesday, May 19, 2009

[Paper] Complete Primate Skeleton from the Middle Eocene of Messel in Germany: Morphology and Paleobiology

者:Jens L Franzen, Philip D Gingerich, Jörg Habersetzer, Jørn H Hurum, Wighart Von Koenigswald, B. Holly Smith and John Hawks
出處:Plos ONE. 2009. 4. e5723.  
(
Link to the article)
摘要:
     一個研究團隊在德國發現目前保存最完整的靈長類化石,取名為Darwinius masillae,這隻靈長類生活在四千七百萬年前,研究者藉由外型特徵,重現了她的生活史,這可以解答一些人類演化的問題。

Monday, May 18, 2009

[Paper] Hermaphroditic Sex Allocation Evolves When Mating Opportunities Change

作者:Marcel E. Dorken and John R. Pannell
出處:Current Biology. 2009. 19. 514.
(Link to the article)
摘要:
理論預測,在androdioecy或gynodioecy的族群中,兩性株會將資源多投資在與單性株相反的生殖功能上,例如在gynodioecy中,兩性株會加強雄性生殖功能的投資,因為雄性生殖功能越強的兩性株越有機會將其他胚株受孕。
本篇論文的作者以Mercurialis annua這種androdioecious的植物為實驗材料,建立數個實驗族群。半數的實驗族群只有兩性株,另外一半作者將雄株與兩性株的比例大致維持在1:1,這樣的實驗族群維持了三年,每年的作者會收集種子然後建立下一代的實驗族群。他們測量了每個族群內兩性株的雄性與雌性生殖功能,結果發現,三年過後沒有雄株的族群其兩性株投資了較多的資源在雄性生殖功能上,這樣的結果符合作者的預期,也就是當雄株消失時,天擇傾向篩選出雄性生殖功能較強的兩性株。
以下的文章與本篇paper同期,是這篇文章的導讀:
Sex Allocation: Evolution to and from Dioecy
作者:Lynda F. Delph
出處:Current Biology. 2009. 19. R249.