Friday, January 28, 2011

[Software] MEGA5 for Mac is out





MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis)是一個相當不錯的分子演化/譜系分析的工具,1993年以來,一直都只在Windows系統中可用;在經過一陣子的beta測試後,正式版MEGA5 for Mac終於出版了。有興趣的人可以到MEGA的網頁去下載,是免費的。
(Of course there is a MEGA5 for Win as well. Check the one you prefer.)

Thursday, January 20, 2011

[Paper] Primitive agriculture in a social amoeba

Authors:
Debra A. Brock, Tracy E. Douglas, David C. Queller & Joan E. Strassmann

Paper: Nature 469:393-396. (Direct link to Nature website)

Abstract
科學家們第一次發現黏菌也會進行農業!作者們在野外採集時發現,當一種阿米巴Dictyostelium discoideum在吃細菌後,其形成的fruiting body中,約有1/3會把沒吃完的細菌包在裡面,另外2/3則不會有細菌在fruiting body中。當孢子抵達新的環境後,若當地沒有他們喜歡的細菌,則有帶細菌的阿米巴會活得比較好,但若所到的新環境有很多他們喜歡的細菌,則沒帶的阿米巴會活得較佳。 (- 是的,連阿米巴也會挑食。)

明顯的這是一種聰明的生存策略,也在族群中保持了一個巧妙的平衡。

The Scientist中也有介紹這篇文章的報導,可以先看。

Wednesday, January 12, 2011

[Paper] Nitrogen stress response of a hybrid species: a gene expression study

出處: Annals of Botany, 2011, 107: 101-108
作者: Larry C. Brouillette and Lisa A. Donovan

摘要:
Helianthus anomalus是一種雜交起源的一年生向日葵,根據先前的研究顯示,相較於父母親本,此雜交種可生活於較低肥沃度的土壤當中,也產生相對適應的特徵,包含較低的生長速率與較長的葉子存活時間。cDNA microarray的方式發現此三種物種在不同營養處理下,會有不同的表現情況。已經screen到5個可能參與基因,其中一個的同源基因是阿拉伯芥葉子老化有關的基因-catalase 1。作者認為這樣的研究有助於生活在貧瘠環境的作物基因調控的了解

[Paper] Sexual dimorphism in resource acquisition and deployment: both size and timing matter

出處: Annals of Botany, 2011, 107: 119-126
作者: Julia Sa´nchez Vilas and John R. Pannell

摘要:
雌雄異株的植物,因為功能性的差別,雌雄個體在生活史或是植物個體的大小也會有不同。本篇文章使用一年生雌雄異株的Mercurialis annua作為研究材料,了解不同性別隨著生長時間的改變,碳與氮對於生長及生殖組織上資源的分配。結果發現在生殖初期,雄株會比雌株分配較多資源,此趨勢到了晚期則會相反。在晚期時,雄株相對而言投資較多部份在根部,但是實際上雌株的根會比較大。研究證實雌雄個體的資源分配,不僅在空間上,在時間上也會有性別分化的產生。