Sunday, January 17, 2010

[Paper] Article-Level Metrics and the Evolution of Scientific Impact

作者:Cameron, Shirley Wu
出處:Plos Biology. 2009. 7. e1000242.

摘要:
隨著科學發展日新月異,每年發表的科學文章數也越來越多,研究者顯然不可能看完所有文章,因此通常大家會希望優先閱讀所謂"好的"或者"重要的"文章。目前大部分的人習慣是先挑選好的期刊,然後閱讀裡面的文章,可是什麼是"好的"期刊呢?單純以impact factor來評斷期刊的優劣是有問題的,而且更重要的是,好的期刊裡的文章不見得就是好的,或者說,不一定符合研究者的需求。Journal impact 不等於article impact!
根據以上的理由,作者認為,科學家需要好的方法來篩選及度量文章 (article-Level Metrics),取代目前以度量期刊為主的選擇方法。作者列了幾個方法,但是每一種都有一些優點或缺點。例如文章引用數很具代表性,可是需要一段長時間的等待才有結果;點閱數或下載數短時間就可以知道答案,但是代表性可能有問題;網路上的評論有時帶來很好的交流機會,可是目前規模還不夠大,而且有一些制度問題如果不解決,很難讓每位研究者都願意發言…。以上這些方法無所謂優劣,哪一種方法較合適應該要看每個人的個性與需求。

心得:
目前還沒有可以概括所有的優點的方法,不知道有沒有人有好的點子?

Tuesday, January 12, 2010

[Paper] Parthenogenesis Maintains Male Sterility in a Gynodioecious Orchid

作者:

Shuang‐Quan Huang,

Yang Lu,

Ying‐Zhuo Chen,

Yi‐Bo Luo, and

Lynda F. Delph

出處:American Naturalist. 2009. 174. 578.
摘要:
Satyrium ciliatum (緣毛鳥足蘭)是蘭科中唯一gynodioecious (雌花/ 兩性異株花的物種)的例子。在不同的族群中,雌株與兩性株的比例有很大的變化,有些族群甚至只有雌株的存在,且seed-set在所有的族群中都很高,這很不尋常,因為在缺乏兩性株的族群內,Seed-set應該會因為pollen limitation的影響而降低,而且雌株在族群中的比例也不會太高。實驗證實,S. ciliatum的花即使不經過授粉,也可以經由無性生殖產生種子。這項機制幫助S. ciliatum雌株可以用很高的頻度存在於族群中。

補充:以下的文章是Current Biology上針對這篇文章的介紹。
作者:John R. Pannell
出處:Current Biology. 2009. 19. R983.

Monday, January 11, 2010

[Paper] Correlated Evolution of Sexual System and Life-History Traits in Mosses

作者:Monique Crawford, Linley K. Jesson and Phil J. Garnock-Jones
出處:Evolution. 2009. 63. 1129.
摘要:
本文研究苔類植物 (mosses)的性別系統演化與其生活型態的關係,結果發現,具有較大體型的苔類,配子體比較容易具有性別分化。另外,孢子越小的苔類也比較多性別分化的例子。染色體數較高的種類則有比較高的比例是不具性別分化。
心得:在描述苔蘚植物的生殖系統時,雖然有些詞彙與被子植物一樣,但是所指的意義不同,因為苔蘚植物的配子體世代明顯,因次這些詞彙的描述以配子體世代為主,而被子植物的描述以孢子體世代為主。

Thursday, January 7, 2010

[Paper] The evolution and ecology of masquerade

作者:John Skelhorn, Hannah M Rowland, Graeme D Ruxton
出處:Biological Journal of the Linnean Society. 2010. 99. 1.
(Link to the article)
摘要:
Masquerade照字面有假裝、化妝、冒充與假面舞會的意思。根據這篇文章,masquerade在生物學上的定義是,生物的外形藉由偽裝,造成其他生物錯誤的認知,因此增加masquerader的生存優勢。這概念乍看之下與擬態很像,但是本質不同。在擬態的例子中,例如Batesian mimics,被擬態的生物 (model)會因為擬態者的存在,使得掠食者或被掠食者的行為受到改變,而影響其生存。在
masquerade的例子中,被模仿的model並不會受到其他生物的影響。像是外形很像鳥糞的蜘蛛 (Ornithoscatoides decipiens),或是外形像樹枝的竹節蟲,都算是masquerade。
這篇文章給予
masquerade嚴謹的定義,並且回顧過去的研究,以及提出未來的研究方向,雖然masquerade在自然界中並不少見,可是我們對於這個現象的了解還是很少。

Wednesday, January 6, 2010

[Paper] How to be an attractive male: floral dimorphism and attractiveness to pollinators in a dioecious plant

作者:Marc O Waelti, Paul A Page, Alex Widmer and Florian P Schiestl
出處:BMC Evolutionary Biology. 2009. 9: 190.
摘要:
Sexual selection theory預測在雌雄異株的植物中,雄性生殖功能比較容易受到傳粉機會的限制,相對的,雌性生殖功能比較容易受到可養育後代資源多寡的限制。因此,對動物傳粉的植物,天擇應該傾向增加雄花的吸引力,用來吸引更多的授粉者,另一方面,天擇可能降低雌花的吸引力,避免草食動物找上門破壞雌花。本文研究Silene latifolia的傳粉物學。這種植物的傳粉者是夜間活動的蛾類,而且特別的是,蛾類傳粉者會在雌花下蛋,幼蟲孵化後會食用S. latifolia的種子。花部外型測量與化學分析顯示,雖然雄花的floral display沒有雌花大,但是雄花產生的氣味化學物質明顯比雌花多。測試蛾類傳粉者對雄花和雌花的偏好實驗顯示,雄蛾對雄花會有明顯的偏愛,可是雌蛾則對兩種花沒有特別的喜好。綜合以上結果,S. latifolia的雄花顯然以氣味增加自己的吸引力,而這種趨勢符合Sexual selection theory的預測。
補充:
作者在討論有提到,雌蛾如果發展出對雌花特別的偏好,應該也很合理,不過實驗結果並不是如此,或許懷孕的雌蛾與一般的雌蛾對花朵的偏好並不同。

Monday, January 4, 2010

[Paper] A comparison of pollen-siring ability and life history between males and hermaphrodites of subdioecious Silene acaulis

作者:Marianne Philipp, Ruth Bruus Jakobsen and Gösta Nachman
出處:Evolutionary Ecology Research. 2009. 11. 787.
摘要:
Silene acaulis生長在北極圈內或是高山上等寒冷的地方,是一種座墊狀植物 (cushion plant),族群中具有雄株,兩性株和雌株等不同的個體,因此生殖系統屬於subdioecy。本文想要探討,不同性別的個體生殖能力是否不同,藉以預測在未來,S. acaulis的生殖系統是否會朝向dioecy或gynodioecy演化?實驗結果顯示,雄株的花朵比起兩性株雖然產生較多有活性花粉,不過花粉替種子受孕的能力在這兩種性別中並無顯著不同。而兩性株的大小明顯大於雄株,因此產生較多花朵,這使得兩性株具有額外的優勢。綜合各項資訊,理論模式預測如果S. acaulis生長的環境不變,其生殖系統最後會演變為gynodioecy。
心得:
完成各項與繁殖有關的測量後,就可以用簡單的數學 (這篇文章最後的model只有用到加法和乘除法而已)預測未來的模式,我覺得這是很好的研究。雖然只要用到model,難免都會有過分簡化的疑慮在。

Sunday, January 3, 2010

[Paper] Pollination mode and life form strongly affect the relation between mating system and pollen to ovule ratios

作者:Stefan G. Michalski and Walter Durka
出處:New Phytologist. 2009. 183. 470.
摘要:
Pollen to ovule ratio (P-O ratio; 花粉-胚株比)常被認為與植物的異交程度 (outcrossing rate)有關,換句話說,P-O ratio越大可能暗示了植物比較傾向outcrossing。但是除了mating system,P-O ratio也可能與其他因子有關,例如pollination mode (e.g. Biotic or Abiotic)或life form (e.g. woody or herbaceous)。本文檢視了P-O ratio與outcrossing rate, pollination mode與life form之間的關係。結果發現,在風煤傳粉的植物中,P-O ratio的確與outcrossing rate成正比,但是這樣的關係在動物傳粉的植物中並不明顯,另外,木本植物比起草本植物具有較高的P-O ratio,且木本植物的P-O ratio不隨著outcrossing rate而變化。這些結果顯示,pollination mode與life form對P-O ratio的影響可能比outcrossing rate還要大。