April 27th, 2007 by easss
文章標題:Conservation of B class gene expression in the second whorl of a basal grass and outgroups links the origin of lodicules and petals
作者:Clinton J. Whipple, Michael J. Zanis, Elizabeth A. Kellogg, and Robert J. Schmidt
出處: PNAS 2007;104;1081-1086
2007.104.1081.pdf
說明: 在典型的禾草中lodicule（鱗被）在過去的研究裡（如玉米與水稻）已知是等同於花瓣的退化痕跡,然而對於一些未演化出lodicule的禾草目植物則是在雄蕊外以一輪到兩輪的花被片保護著生殖構造,為了解這些非禾本科的單子葉植物B群基因(PI及AP3)的表現與演化,這篇文章在禾本目中分別選了非草本也無lodicule的Elegia與Joinvillea,以及草本但無lodicule的Streptochaeta,與現有的研究做比較,推論禾草的lodicule以及草本Streptochaeta的X-XII bracts應該是從其他禾本目的inner tepal或是第二輪花被所modified來的,這個研究告訴了我們B群基因在草本或非草本單子葉植物演化中第二輪花被的功能保守性.
禾草植物鱗被的演化史以及B群基因的表現
Friday, April 27, 2007
Thursday, April 26, 2007
[Paper] 生物史上最快的運動速度
April 26th, 2007 by Zn
出處:
Philip E. Taylor, Gwyneth Card, James House, Michael H. Dickinson and Richard C. Flagan. 2006. High-speed pollen
release in the white mulberry tree, Morus alba L. Sexual Plant Reproduction 19: 19-24. pdf file
說明:
本篇文章主要是針對雌雄異株之桑樹雄蕊發育過程的觀察。研究結果發現，桑樹雄蕊早期內曲於花芽內，雄蕊成熟時，藉由一種絲狀物與退化性雌蕊的協助，讓雄蕊由原本的彎曲狀態，迅速地彈起直立，以達到傳播花粉的目的，而這整個運動過程竟然不到25微秒！這是生物學界到目前為止，觀察到生物運動之最快速度。
p.s. 本篇文章有附影片, 不過最近好像壞了…
出處:
Philip E. Taylor, Gwyneth Card, James House, Michael H. Dickinson and Richard C. Flagan. 2006. High-speed pollen
release in the white mulberry tree, Morus alba L. Sexual Plant Reproduction 19: 19-24. pdf file
說明:
本篇文章主要是針對雌雄異株之桑樹雄蕊發育過程的觀察。研究結果發現，桑樹雄蕊早期內曲於花芽內，雄蕊成熟時，藉由一種絲狀物與退化性雌蕊的協助，讓雄蕊由原本的彎曲狀態，迅速地彈起直立，以達到傳播花粉的目的，而這整個運動過程竟然不到25微秒！這是生物學界到目前為止，觀察到生物運動之最快速度。
p.s. 本篇文章有附影片, 不過最近好像壞了…
[Paper] 基因影響授粉者改變
April 26th, 2007 by thow
出處：
Maria Elena Hoballah, Thomas Gübitz, Jeroen Stuurman, Larissa Broger, Mario Barone, Therese Mandel, Alexandre Dell’Olivo,
Maeva Arnold, and Cris Kuhlemeier. Single Gene-Mediated Shift in Pollinator Attraction in Petunia. Plant Cell published March 2, 2007. Single Gene-Mediated Shift in Pollinator Attraction in Petunia. .
說明：
在Peunia hybrida中找到的ANTHOCYANIN2 (AN2)與花色有關，突變後會使原本桃紅的花色變為白色，也確實會影響授粉者的偏好與行為，作
者們另外針對一種白花的矮牽牛Petunia axillaris，其AN2基因homolog已失去功能，轉殖正常AN2後會使花色變紅，比較原始白花與轉殖的紅花植株同樣會造成授粉者有不同的偏好，顯示這個基因確實與植物和授粉者間的關連性有關，另外作者也提到了在植物與傳粉者間演化歷史這類的問
題。
出處：
Maria Elena Hoballah, Thomas Gübitz, Jeroen Stuurman, Larissa Broger, Mario Barone, Therese Mandel, Alexandre Dell’Olivo,
Maeva Arnold, and Cris Kuhlemeier. Single Gene-Mediated Shift in Pollinator Attraction in Petunia. Plant Cell published March 2, 2007. Single Gene-Mediated Shift in Pollinator Attraction in Petunia. .
說明：
在Peunia hybrida中找到的ANTHOCYANIN2 (AN2)與花色有關，突變後會使原本桃紅的花色變為白色，也確實會影響授粉者的偏好與行為，作
者們另外針對一種白花的矮牽牛Petunia axillaris，其AN2基因homolog已失去功能，轉殖正常AN2後會使花色變紅，比較原始白花與轉殖的紅花植株同樣會造成授粉者有不同的偏好，顯示這個基因確實與植物和授粉者間的關連性有關，另外作者也提到了在植物與傳粉者間演化歷史這類的問
題。
Tuesday, April 24, 2007
[Paper] 植物比較基因體學進展
April 24th, 2007 by jmhu
出處：
Bowman, J. L., S. K. Floyd, and K. Sakakibara. 2007. Green genes - comparative genomics of the gree branch of life.
Cell 129: 229-234. Cell2007.129.229 is here
說明：
這是一篇簡短的review，說明目前植物基因體學的進展，以及它對植物演化的重要事件的影響。作者是從UC Davis轉戰到澳洲Monash University的John Bowman，文中所切入的角度還蠻大的。
出處：
Bowman, J. L., S. K. Floyd, and K. Sakakibara. 2007. Green genes - comparative genomics of the gree branch of life.
Cell 129: 229-234. Cell2007.129.229 is here
說明：
這是一篇簡短的review，說明目前植物基因體學的進展，以及它對植物演化的重要事件的影響。作者是從UC Davis轉戰到澳洲Monash University的John Bowman，文中所切入的角度還蠻大的。
Monday, April 23, 2007
[Paper] R2R3 MYB transcription factors 調控花瓣發育
April 23rd, 2007 by thow
出處：
Kim Baumann, Maria Perez-Rodriguez, Desmond Bradley, Julien Venail, Paul Bailey, Hailing Jin, Ronald Koes, Keith Roberts, and Cathie Martin. Control of cell and petal morphogenesis by R2R3 MYB transcription factors.
Development 2007 134: 1691-1701.
說明：
在金魚草(Antirrhinum majus)中，MIXTA這個R2R3 MYB轉錄因子基因已知會調控花冠筒內面表皮細胞的發育，使細胞呈現圓錐狀(conical)，這篇文章的作者們將在譜系分析上與MIXTA相近的幾個基因，包括金魚草的AmMYBML2、阿拉伯芥(Arabidopsis thaliana)的AtMYB16以及矮牽牛(Petunia hybeida)的PhMYB1轉殖到菸草內，發現他們的功能與MIXTA的確類似；另外在矮牽牛中利用transposon插入製
造出不穩定的PhMYB1 mutant，藉由此類突變株觀察到花瓣表皮細胞的形態會影響到整個花辦或花冠的外型，顯示這群R2R3 MYB transcription factor可調控細胞型態並且進而影響花的外型，而這兩者都與植物吸引傳粉者的能力有關。
出處：
Kim Baumann, Maria Perez-Rodriguez, Desmond Bradley, Julien Venail, Paul Bailey, Hailing Jin, Ronald Koes, Keith Roberts, and Cathie Martin. Control of cell and petal morphogenesis by R2R3 MYB transcription factors.
Development 2007 134: 1691-1701.
說明：
在金魚草(Antirrhinum majus)中，MIXTA這個R2R3 MYB轉錄因子基因已知會調控花冠筒內面表皮細胞的發育，使細胞呈現圓錐狀(conical)，這篇文章的作者們將在譜系分析上與MIXTA相近的幾個基因，包括金魚草的AmMYBML2、阿拉伯芥(Arabidopsis thaliana)的AtMYB16以及矮牽牛(Petunia hybeida)的PhMYB1轉殖到菸草內，發現他們的功能與MIXTA的確類似；另外在矮牽牛中利用transposon插入製
造出不穩定的PhMYB1 mutant，藉由此類突變株觀察到花瓣表皮細胞的形態會影響到整個花辦或花冠的外型，顯示這群R2R3 MYB transcription factor可調控細胞型態並且進而影響花的外型，而這兩者都與植物吸引傳粉者的能力有關。
Thursday, April 19, 2007
[Paper] The genetics of sex determination
April 19th, 2007 by Zn
出處：Robynn K. Shannon and Kent E. Holsinger (2007) The genetics of sex determination in stinging nettle (Urtica
dioica). Sexual Plant Reproductive 2007. 20. 35.pdf
說明：蕁麻 (Urtica dioica)為一種同時具有雌雄異株及雌雄同株的植物，依照生殖系統的不同，有人將其處理為兩個變種。作者利用人工授粉的方式，將蕁麻的雌雄同株及雌雄異株兩個變種進行交互雜交的實驗，並觀察所產生的子代性別模式。結果顯示母本的生殖系統會影響子代的性別決定。作者並進一步探討有關雌雄異株植物的演化可能機制 。
這篇文章跟之前老師所貼一篇文章有些相似，差別在於該篇文章是討論雌雄異株中母本族群性別比例會影響子代性別比例，本篇則是討論兩個變種所產生的子代之性別決定。
出處：Robynn K. Shannon and Kent E. Holsinger (2007) The genetics of sex determination in stinging nettle (Urtica
dioica). Sexual Plant Reproductive 2007. 20. 35.pdf
說明：蕁麻 (Urtica dioica)為一種同時具有雌雄異株及雌雄同株的植物，依照生殖系統的不同，有人將其處理為兩個變種。作者利用人工授粉的方式，將蕁麻的雌雄同株及雌雄異株兩個變種進行交互雜交的實驗，並觀察所產生的子代性別模式。結果顯示母本的生殖系統會影響子代的性別決定。作者並進一步探討有關雌雄異株植物的演化可能機制 。
這篇文章跟之前老師所貼一篇文章有些相似，差別在於該篇文章是討論雌雄異株中母本族群性別比例會影響子代性別比例，本篇則是討論兩個變種所產生的子代之性別決定。
Wednesday, April 18, 2007
[Paper] 成功建立寄生植物Triphysaria的轉殖系統
April 18th, 2007 by jmhu
出處：
Tomilov, A., N. Tomilova, and J. I. Yoder. 2007.
Agrobacterium tumefaciens and Agrobacterium rhizogenes transformed roots of the parasitic plant Triphysaria versicolor retain parasitic competence. Planta 225:1059-1071. pdf of Planta2007.225.1059 here.
說明：
Triphysaria versicolor是一個列當科的兼性寄生(facultatively parasitic)植物，意即它可以自營，也可以在有宿主的環境下發育吸器(haustorium)來行寄生。在前兩年已經建立了這個種的EST database，以釣取吸器產生相關的基因。這篇文章成功的利用Agrbacterium轉殖，GUS/GFP/genomic PCR等方法，確立了這個植物的轉殖系統。轉殖後的植株也仍有寄生的能力，所以這個系統當可應用於接下來的遺傳研究。
Haustorium development in transgenic Triphysaria roots treated with 30 M DMBQ and stained with X-Glu GUS 24 h later (擷自文
中之圖一)
延伸閱讀：
Torres MJ, Tomilov AA, Tomilova N, Reagan RL, Yoder JI (2005) Pscroph, a parasitic plant EST database enriched for parasite
associated transcripts. BMC Plant Biol 24:24. .
出處：
Tomilov, A., N. Tomilova, and J. I. Yoder. 2007.
Agrobacterium tumefaciens and Agrobacterium rhizogenes transformed roots of the parasitic plant Triphysaria versicolor retain parasitic competence. Planta 225:1059-1071. pdf of Planta2007.225.1059 here.
說明：
Triphysaria versicolor是一個列當科的兼性寄生(facultatively parasitic)植物，意即它可以自營，也可以在有宿主的環境下發育吸器(haustorium)來行寄生。在前兩年已經建立了這個種的EST database，以釣取吸器產生相關的基因。這篇文章成功的利用Agrbacterium轉殖，GUS/GFP/genomic PCR等方法，確立了這個植物的轉殖系統。轉殖後的植株也仍有寄生的能力，所以這個系統當可應用於接下來的遺傳研究。
Haustorium development in transgenic Triphysaria roots treated with 30 M DMBQ and stained with X-Glu GUS 24 h later (擷自文
中之圖一)
延伸閱讀：
Torres MJ, Tomilov AA, Tomilova N, Reagan RL, Yoder JI (2005) Pscroph, a parasitic plant EST database enriched for parasite
associated transcripts. BMC Plant Biol 24:24. .
[Paper] 成功建立寄生植物Triphysaria的轉殖系統
April 18th, 2007 by jmhu
出處：
Tomilov, A., N. Tomilova, and J. I. Yoder. 2007.
Agrobacterium tumefaciens and Agrobacterium rhizogenes transformed roots of the parasitic plant Triphysaria versicolor retain parasitic competence. Planta 225:1059-1071. pdf of Planta2007.225.1059 here.
說明：
Triphysaria versicolor是一個列當科的兼性寄生(facultatively parasitic)植物，意即它可以自營，也可以在有宿主的環境下發育吸器(haustorium)來行寄生。在前兩年已經建立了這個種的EST database，以釣取吸器產生相關的基因。這篇文章成功的利用Agrbacterium轉殖，GUS/GFP/genomic PCR等方法，確立了這個植物的轉殖系統。轉殖後的植株也仍有寄生的能力，所以這個系統當可應用於接下來的遺傳研究。
出處：
Tomilov, A., N. Tomilova, and J. I. Yoder. 2007.
Agrobacterium tumefaciens and Agrobacterium rhizogenes transformed roots of the parasitic plant Triphysaria versicolor retain parasitic competence. Planta 225:1059-1071. pdf of Planta2007.225.1059 here.
說明：
Triphysaria versicolor是一個列當科的兼性寄生(facultatively parasitic)植物，意即它可以自營，也可以在有宿主的環境下發育吸器(haustorium)來行寄生。在前兩年已經建立了這個種的EST database，以釣取吸器產生相關的基因。這篇文章成功的利用Agrbacterium轉殖，GUS/GFP/genomic PCR等方法，確立了這個植物的轉殖系統。轉殖後的植株也仍有寄生的能力，所以這個系統當可應用於接下來的遺傳研究。
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