Tuesday, October 26, 2010

[Paper] An Atlas of Type I MADS Box Gene Expression during Female Gametophyte and Seed Development in Arabidopsis

Authors: Marian Bemer, Klaas Heijmans, Chiara Airoldi, Brendan Davies and Gerco C. Angenent
Source: Plant Physiology (2010) 154:287-300.
Abstract:
Type I的MADS-box基因研究的人比較少,在阿拉伯芥中有61個copies,但是除了PHERES1, AGL80, DIANA, AGL62, AGL23之外,幾乎沒有什麼報導。主要的原因在於大部份T-DNA insertion的mutant沒有什麼phenotype。作者利用系統性的gene expression研究,顯示這些基因大多表現於female gametophyte和早期的seed development。相對於MIKCc-MADS genes,是蠻有意思的比較,也許和世代交替的改變有關連。

[Paper] Computational morphodyamics: a modeling framework to understand plant growth

Authors: Vijay Chickarmane, Adrienne H.K. Roeder, Paul T. Tarr, Alexandre Cunha, Cory Tobin, and Elliot M. Meyerowitz
Source: Annu. Rev. Plant Biology (2010) 61:65
Abstract:
這是一篇有關電腦模擬植物生長模式的review,作者們舉了很多的例子,說明目前modeling的應用性。Computer modeling在近幾年應用在植物生長,自細胞、個體、以至群聚模型上都有很大的進展。在不同參數的選擇下,可以模擬出各種發育的狀況。有興趣的人可以參考如CellModellerOpenAlea等的網站,體驗一下這些新的工具。

[Paper] Land plant life cycle

Authors: Karl J. Niklas and Ulrich Kutschera
Journal: New Phytologist (2010) 185:27
Abstract:
A paper summarized the evolution of life cycle in land plants. 雖然是一篇review,但是在分子證據的解讀上,有一些錯誤,讀的時候要小心。