Sunday, May 13, 2007

[Paper] The Shapes of Phylogenetic Trees of Clades, Faunas, and Local Assemblages: Exploring Spatial Pattern in Differential Diversification

May 13th, 2007 by basa
作者:Stephen B. Heard and Graham H. Cox
出處:The American Naturalist; 2007; 169; E107-E117.pdf file
說明:
生物的演化樹往往是不對稱的,也就是某幾個支系分化的程度特別高。
這樣的現象可以稱為diversity skewness。關於diversity skewness定義和計算的方法 (本文介紹的Ic法是一種簡單又實用的方法),請參考附圖和公式。
作者特別強調,以往關於diversity skewness的研究對象都是全球性的整個clade,本文描述了研究地區性的diversity skewness的方法,作者
並實際分析了primates在全球性以及地區性的diversity skewness,作為示範。
Ic的計算方法:
n = n species in the tree
SR, SL = the right and left branches at a node
Phylogenetic illustratuins of diversity skewness ; Left:Ic = 0.2
Right:Ic = 1

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