Saturday, August 11, 2007

[Paper] Three distinct modes of intron dynamics in the evolution of eukaryotes

August 11th, 2007 by aerobe
作者: Liran Carmel, Yuri I. Wolf, Igor B. Rogozin, and Eugene
V. Koonin
出處: Genome Research 2007, 17:1034-1044
說明:
本研究建構了包含19個真核生物物種、391組基因的資料庫,發展了可以重建intron演化的模型(comprehensive probabilistic model)。這個模型推論真核生物最近的共同祖先含有 >2.15 introns/kb,而多細胞生物最近共同祖先則有3.4 introns/kb。而intron-exon構造的演化有三種不同的模式:
一、平衡模式,intron的獲得與丟失成正相關,作用在所有的lineage上;
二、intron丟失的速率提高,在真菌及昆蟲中普遍;
三、intron獲得的速率提高,只在演化樹較深的分支(deep branches)上見到。

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