[Paper]Biodiversity conservation in cocoa production landscapes: an overview

October 11th, 2007 by milkdog
作者:Götz Schroth, Celia A. Harvey
出處:Biodivers Conserv (2007) 16:2237–2244
說明:
可可樹 (cocoa) 是現今廣泛分布於拉丁美洲,非洲以及亞洲的經濟作物,為人類最重要經濟作物之一,年產量高達三百萬噸.由於其佔地廣闊,因此
人類經濟對生態學的影響也常由此做延伸的研究.在對可可樹經濟林內的生物象調查之後發現,此種林內的生物多樣性往往高於其他類型的經濟作物林(當然仍不及原始林的生物多樣性).但此項發現,也顯示農業經濟與生態保育兩者之間,未必是完全的對立,而是有一個可能的兩贏平衡點存在.此篇文章回顧了九項,分別是在拉丁美洲,非洲及亞洲的可可樹林內所做的研究.研究方向各有差異,但結果都相對為可可樹林內的生態平衡,以及人類該做的管理,下了一些重要的參考依據.作者簡單歸類出四點:

1. 欲進行可可樹的經濟造林,當務之急是要優先保育原本就已存在在該地的原始林,避免原始棲地因開發而過於破碎.
2. 除避免棲地破碎化外,保持林內樹種多樣性,,避免其單純化(simplification).
3. 因為種植可可樹這種行為,已經將原本的樹林多樣性給單純化了,所以管理者該朝兩個方向去計畫來增進生物多樣性:栽種新樹種以及促進自然再生 (natural regeneration).前者的樹種可以選擇對農民有正面幫助的其他樹種 (如當地果樹,或是木材用樹),當然也必須包括對動物相 (fauna) 有所助益的樹種.
4. 除了當地的可可樹林,也必須著眼於整個地景系統中的其他地區,如週遭的牧地,河流區…等

以上可見生態保育的工作,涵蓋了各項複雜因子,吃巧克力的時候還得飲水思源一下

[Paper]Phenotypic plasticity in the holoparasitic mistletoe Tristerix aphyllus (Loranthaceae): consequences of trait variation for successful establis

September 30th, 2007 by milkdog
作者:Gonzales, WL, Author, Reprint Author Gonzales Wilfredo L.
Gonzales, Wilfredo L. , Suarez, LH, et al.
出處:EVOL ECOL 21 (3): 431-444 JUN 2007
說明:生物體對於環境的改變,是否能做出對等的應變,通常是影響其適應度(Fitnees) 的關鍵.而在這篇研究之中,主要著眼在寄生物是否會對寄主之微環境,對應出成功的phenotypic plasticity.研究對相分別為Tristerix aphyllus (一種懈寄生) 還有其宿主Echinopsis chilensis (一種仙人掌),並探討此種懈寄生在其仙人掌宿主上的之播種型式,還有種子萌發的情形.而結果也顯示,此種懈寄生幼苗在宿主上的胚根長度,具有顯著的 phenotypic plasticity.

[Paper] Use of Digital Image Analysis, Viability Stains, and Germination Assays to Estimate Conventional and Glyphosate-resistant Cotton Pollen Viab..

September 24th, 2007 by basa
作者: Wendy A. Pline, Keith L. Edmisten, Tim Oliver, John W. Wilcut, Randy Wells,
and Nina S. Allen
出處: Crop Science (2002) 42: 2193-2200
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作者比較了四種不同估計花粉活性的方法，分別是Brewbaker & Kwack (B & K) medium (就是蔗糖溶液以及少許的硼和鈣、Pollen
germination test in vitro)、B & K medium 加上 aniline blue、fluorochromatic reaction method (FCR)、還有Alexander’s stain。
作者用棉花的花粉進行測試。除了以上述四種方式估計花粉活性，作者也對棉花進行人工授粉實驗，得到結實率以後再和四種活性測試的值進行比較，看看哪一種方法和結實率的相關性最高。

此外，作者嘗試將花粉萌發的結果照相紀錄，並用影像軟體分析花粉管的面積，藉由比較花粉管面積的大小，可以增加對花粉活性的參考資
料。實驗的結果顯示，B & K medium和結實率的相關性最高，除此之外，作者認為B & K medium實驗簡單，需要的特殊器材少，以及允許影像處理分析花粉管的面積，因此是值得推薦的方法。

最後再補充一下為什麼作者的試驗方法中，其中一項是在B & K medium中加入aniline blue。由於在蔗糖溶液中，花粉有時會受到滲透壓的影響而爆裂放出一些花粉內的物質，這種情形並不是真正的花粉萌發，但是在外觀上有時會很類似正常萌發的花粉管，因此造成計算萌發率時的困擾。正常的花粉管含有callose，callose會出現在花粉管中(callose plug)，而且花粉管璧的成分也包含callose，因此我們可以試著用aniline blue對花粉管染色，如果是正常的花粉管，就會成功染上色，藉以判斷花粉是否正常萌發。

[Paper]植物的種化

September 17th, 2007 by pai
作者: Loren H. Rieseberg and John H. Willis
出處: Science 2007, 317:910-914 | Supporting Material
說明: 如標題所述，這是一篇關於植物種化的Review。今天中午王俊能老師已經介紹過他的內容，而其附錄中整理了許多關於植物種化相關的研
究，這學期要參與討論的人可以參考一下。

Diversification and co-option of RAD-like genes in the evolution of floral asymmetry.

September 5th, 2007 by easss
期刊 Plant Journal 2007 Aug 2
作者:Baxter CE, Costa MM, Coen ES.
簡介:如題所示, 又一篇關於花的對稱性相關的paper出來了,作者藉由金魚草和阿拉伯芥中RAD基因的 duplication and divergence認為RAD基因參與了一系列分子間或分子內的調控改變,有興趣者可以去看看…

[Paper] Genetic and physical maps around the sex-determining M-locus of the dioecious plant asparagus

September 4th, 2007 by aerobe
作者： Alexa Telgmann-Rauber, Ari Jamsari, Michael S. Kinney,
J. Chris Pires and Christian Jung Koonin
出處： Mol Genet Genomics 2007, 278:221-234
說明：
Asparagus ocinalis L. (蘆筍)為雌雄異株的植物。其同型性染色體上有個M-locus區域，其功能為調控雌雄的性狀。本篇研究即為將蘆筍的性別決定區域選殖出來，及研究此區域的構造。作者更進一步推測Silene、木瓜以及蘆筍代表了XX、XY性別決定系統在演化上的三個階段。

[Paper] Dating the origin of the Orchidaceae from a fossil orchid with its pollinator

September 4th, 2007 by aerobe
作者： Santiago R. Ramı´rez, Barbara Gravendeel, Rodrigo B.
Singer, Charles R. Marshall and Naomi E. Pierce
出處： Nature 2007, 448:1042-1045
說明：
自從達爾文時代以來，生物學家一直為蘭花和它們的授粉者之間的親密關係著迷。這種關係之久遠，從本期封面所示化石就可見一斑。化石中是一只無刺的工蜂，帶著蘭花的一個花粉塊，保存在距今1,500萬至2,000萬年前的琥珀中，是在多米尼加共和國發現的。這個花粉塊是雄性生殖結構，在授粉期間作為一個結構單位被轉移，帶有一團花粉顆粒。該發現讓人吃驚之處是，它是第一個明確來自蘭科的化石。花粉塊的形態說明該蘭花屬於斑葉蘭（Goodyerinae）。通過將這一信息與來自其他相關化石植物的年代數據結合起來，研究人員便獲得了對蘭科植物分子系統發生學的一個新的校正結果。分析結果否定了蘭花起源於較近年代（第三紀）的假設；相反，它表明它們起源於距今8,000萬年前的晚白堊紀。